کتابخانه و مرکز اطلاع رسانی مرکز آموزشی درمانی آیت الله العظمی خوئی (ره) در پی اعتباربخشی آموزشی شدن بیمارستان در سال 1401 توسط وزرات بهداشت، درمان و آموزش پزشکی زیر نظر معاونت آموزشی، تحقیقات و دانشجویی فرهنگی دانشکده علوم پزشکی و خدمات بهداشتی درمانی خوی با انتقال بخشی از کتب فارسی و لاتین کتابخانه بیمارستان شهید آیت الله مدنی، کتابخانه مرکزی معاونت آموزشی دانشکده، و انجمن گسترش فرهنگ کتابخوانی خوی آغاز به کار نمود. اکنون این کتابخانه با خرید کتابهای جدید از سوی معاونت آموزشی، تحقیقات و دانشجویی فرهنگی و بیمارستان در رشته های پزشکی عمومی، پرستاری، اتاق عمل و بیهوشی، اورژانس و فوریت های پزشکی و سایر واحدهای پاراکلینیکی بیمارستان (آزمایشگاه و پاتولوژی، تصویربرداری پزشکی، تغذیه و رژیم درمانی، فناوری اطلاعات سلامت، بهداشت محیط و حرفه ای، توانبخشی، داروخانه، چشم پزشکی، روانپزشکی، مددکاری و ...) آماده ارائه خدمات به اساتید، مربیان، دانشجویان، کارکنان بیمارستان و دانشکده، بیماران و همراهان بیماران در حوزه های موضوعی عمومی و تخصصی می باشد.